简介：阴沉季节，江户川柯南（平地南 配音）以及毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎以及佳奈 配音）和少年侦察团的同伴们一起离开都门，他们行将登上侵占队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感受，时代还结识了斑斓又有着多少分奥秘的女侵占队员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知欢愉的空气很快被发急所替换，战舰上俄然发明一条断失落的手臂，消逝的侵占队员又惹起军方的发急与猜想。本来某国奥秘特务X已经暗暗登上宙斯盾，乘机窃取战舰上的绝密谍报。 为了找出埋没的敌手，柯南以及灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士（绪方贤一 配音）、服部平次（堀川亮 配音）和远山以及叶（宫村落优子 配音）共同努力，与特务睁开连番斗智斗勇的较劲…
